了森林里面，通过波导来探知没有危险的正确的道路。
小智知道，这只雷吉洛克之所以会攻击他们，是因为它是世界初始之树的守护者之一，它的职责就是消灭和驱赶进入世界初始之树的入侵者。
在路卡利欧的带领下，众人进入了世界初始之树的内部，这里面的景观非常漂亮，湖水清澈见底，树木和花朵蓬勃生长，蜻蜻蜓，青绵鸟，七夕青鸟，安瓢虫尼多兰，尼多朗，走路草，拉达，穿山鼠等宝可梦在这里生活得非常幸福。
这里还有很多像菊石兽，多刺菊石兽，触手百合，摇篮百合，化石翼龙，太古盔甲等等这种化石宝可梦。
世界初始之树，由如同树一般模样的岩层所组成，是一个依靠光线补给能量的水晶生命体，与住在世界初始之树里的这只梦幻有着共生关系，被认为是大多数化石宝可梦的起源地。
“这里应该就是世界初始之树的正下方了。”琪朵用她那高科技眼镜分析过后，说道。
“那皮卡丘呢？”
“就在上面。”路卡利欧道。
“那我们赶快走吧。”
众人立马往上赶去。
而琪朵则是先留下，拿出了几十只会飞行的微型机器人，然后又联络了班克斯。
“班克斯，有工作了，快起来。”
“我已经就绪了，大小姐。”
“你快看，这就是世界初始之树的内部，数千年，哦不，应该是数万年没有受到外部的干涉，世界初始之树一直保护着这里的宝可梦们。”
“恭喜你的新发现。”
“要恭贺的话，就留到所有谜题都解开了之后吧。”
“好的。”
“数据分析就拜托你了。”
“遵命。”
“这座岩石山是活着的，自然所创造的矿物生命体，世界初始之树吸收光能，存活了数万年。”
“嗯，不过谜题并没有解开，那就是梦幻跟世界初始之树到底有什么联系。”琪朵道。
结束了通话，琪朵放走了这些微型机器人进行调查，
“路卡利欧，使出波导弹。”
小智自己的路卡利欧，亚朗的路卡利欧，还有小智自己，三发波导弹瞬间便被发射了出去，击毁了琪朵放出去的所有微型机器人。
小智表示，还好我发现琪朵没跟上来，折回来看了一下，要不然险些被这个琪朵酿成大祸。