昏倒在长廊里的少年藤丸立香和少女玛修初相遇。
作为最后一个拥有御主资质的人，藤丸立香被分到b组候选。
而拯救人理的主力却是其他八人组成的a组。
面对着这梦幻般的一切，藤丸立香很少新奇和迷茫。
他认识了在他寝室偷偷吃蛋糕的医生罗曼，认识了游荡在迦勒底的小兽芙芙，认识了身为人造人并叫他为前辈的少女玛修。
【爱尔特璐琪:“芙！芙！”】
【凯茜帕鲁格:“你有病吧？”】
【绫波丽:“和我相同的少女……一样的命运。”】
正当他感到新的生活将在雪山上重新开始的时候，噩梦降临了。
2015年
示巴所观测到的未来领域毫无征兆的消失。
根据计算，人类将于2016年灭亡。
【卢瑟:“人类灭亡？不可能！难道是外星人？或者是第三次世界大战？”】
【丁仪:“还有一年吗？太紧迫了，什么也做不了，人类的科技再怎么爆炸也不能在一年的时间里提升到解决这种危机。”】
【阿不思·邓布利多:“或许魔法可以解决呢？这可是有神秘的世界啊。”】
而示巴也观测到了新的异变。
西历2004年，在日本的冬木市出现了从未出现过的无法观测的领域。
迦勒底将这里假定为人类灭绝的原因，并对此展开实验阶段的第六实验。
那便是灵子转移，回到过去的旅行。
【安倍晴明:“和晓美焰相似的力量，但是回到的过去是平行世界呢？还是真正的过去。”】
【罗曼医生:“其实就是修复历史上的变革点，当修复完成时对现有的时间线毫无影响。”】
【苏:“也就是所谓的濒临毁灭的世界泡吗。”】
将术者灵子化送往过去，通过介入事项，寻找奇点，究明真相或给予破坏的禁断的仪式。
其名为fate grand order！
【阿蒂拉:“抽卡是好文明！”】
……
一切准备妥当之时，迦勒底发生剧烈的爆炸，灵子转移的47名御主全部进入濒死。
【迪达拉:“这爆炸的时机把控的……虽然不是很剧烈，但确是完美时机，我愿称其为恰当的艺术！”】